垂楊柳中心小學(xué)馨園分校前身是具有69年歷史的南磨房中心小學(xué)，2019年4月，學(xué)校積極落實“2019年朝陽區(qū)義務(wù)教育資源調(diào)整實施方案”，納入北京市朝陽區(qū)垂楊柳中心小學(xué)一體化管理，更名為垂楊柳中心小學(xué)馨園分校。學(xué)校一校兩址低高部辦學(xué)，共30個教學(xué)班，學(xué)生1千余名，教職工73名，高級教師10人，區(qū)級及以上骨干教師13人。

學(xué)校始終將德育、智育、體育、美育等有機統(tǒng)一在教育教學(xué)活動中，從物質(zhì)文化、精神文化、制度文化、團隊文化、特色文化等幾個方面夯實教風(fēng)、學(xué)風(fēng)、校風(fēng)，注重教師隊伍建設(shè)，積極開展“變教為學(xué)”、STEAM課程課題研究，努力打造研究型的教師隊伍，注重培養(yǎng)學(xué)生獨立思考能力、創(chuàng)新能力和實踐能力，促進學(xué)生全面、可持續(xù)發(fā)展發(fā)展。科技教育是學(xué)校凸顯和全力打造的特色，目前有10個科技社團，是北京市科技教育示范校。2019年，成立“楊偉楓（模型）工作室”和“李毅（生態(tài)?智模）工作室”兩個小學(xué)科技教育名師工作室，立足集團化辦學(xué)的特色需求和集團辦學(xué)的人才需求，邁上了“品牌提升”的新階段。

學(xué)校先后獲全國校園文化建設(shè)優(yōu)秀校、全國航模特色校、北京市文明校園、北京市科技教育示范校、北京市金鵬科技團模型分團、北京市教育學(xué)會中小學(xué)美育研究會團體會員校、朝陽區(qū)素質(zhì)教育示范校，朝陽區(qū)習(xí)慣培養(yǎng)優(yōu)秀基地校、朝陽區(qū)美術(shù)教育特色校、朝陽區(qū)教科研先進校等榮譽稱號。